خیلی جاها نوشته که سرویس ها رو ریست بدید و اینطور مسائل اما هیچکدوم اینها نیست . من راه حلش رو عنوان می کنم ( البته با مسئولیت خودتون )
فقط کافیه از طریق SSH وصل بشید و دستور زیر رو وارد کنید
nano /etc/my.cnf
اطلاعات داخلش رو داخل یه فایل نوت پد بریزید شاید بدردتون بخوره
و سپس اطلاعات زیر رو داخلش کپی کنید
[mysqld]
default-storage-engine = MyISAM
long_query_time = 3
back_log = 50
max_connections = 500
max_user_connections= 200
key_buffer_size = 512M
myisam_sort_buffer_size = 64M
فایل رو ذخیره کرده و دستور زیر رو بزنید
service mysqld start